エピソード詳細
第1話「ようこそジャングルへ」/ ORIENTACION
シーズン 3, エピソード 1組織の策略にはまり、パマナで逮捕されたマイケル。その彼を罠にはめようとしていたアレックスも、麻薬の密輸容疑をかけられ逮捕される。2人が収監された先、それはＳＯＮＡ（ソーナ）だった。ＳＯＮＡとは、世界中の凶悪犯が集う悪名高き刑務所。政府にも見放され、正に“無法地帯”と化していた。
第2話「第三の男」/ FIRE/WATER
シーズン 3, エピソード 2サラとＬＪが組織に捕えられた…。その事を知ったマイケルは、組織の要求通り、ウィスラーという囚人を連れて脱獄する方法を考え始める。しかし肝心のウィスラーの居所がわからない。ちょうどその時、マイケルはべリックから下水道に潜んでいるという男の情報を入手。早速その男の元へ向かうことに。
第3話「望みなき者」/ CALL WAITING
シーズン 3, エピソード 3囚人たちの親玉ルチェロと話をつけ、マイケルはようやくウィスラーを地上まで連れ出した。しかしウィスラーの素性は判らない上、脱獄の手立てが全く浮かばない…。そんな彼の元へ面会に訪れたリンカーンは、監禁中のサラの写真を手渡す。サラから直接状況を聞きたいマイケルは、携帯電話を探すことに。
第4話「フェンス」/ GOOD FENCES
シーズン 3, エピソード 4リンカーンは、サラとＬＪの救出に失敗。組織はその報復に、サラを殺害した…。マイケルの面会に向かったリンカーン。しかしその事実を弟に伝えることが出来ない。サラの死を露程も知らないマイケルは、本格的に脱獄の準備を始動。早速ＳＯＮＡを囲むフェンスに目をつける。
第5話「作戦開始」/ NTERFERENCE
シーズン 3, エピソード 5組織が提示した脱獄期限は明日。マイケルは、リンカーンに明日の昼間に決行すると伝える。夜の警備は厳重だが、昼間は2人の見張りのみ。必要な物品を揃える傍ら、マイケルは1人の見張りに目星をつけ監視することに。その頃ＳＯＮＡには、ウィスラーを知るという新たな囚人が収監される。
第6話「3時13分」/ PHOTO FINISH
シーズン 3, エピソード 6脱獄予定時刻まで、残り4時間を切った…。マイケルは、見張りの1人が飲むコーヒーに睡眠薬を入れるようリンカーンに依頼。そしてウィスラーとアレックスには、窓から下ろす梯子の準備を指示するが…。ウィスラーの過去を知る新入りの囚人ティグが、彼らの行動に目を光らせていた。
第7話「オオカミ少年」/ VAMANOS
シーズン 3, エピソード 7サラが殺されたことを知ったマイケル。脱獄予定時刻の直前、怒りを爆発させた彼はウィスラーに決闘を申し込む！しかしこれは、囚人たち全員を庭へ集める口実だった。一方、ＦＢＩの元同僚たちに連れられＳＯＮＡを出たアレックス。組織の陰謀を証言する代りに、他の施設へ移送されるはずだったが…。
第8話「強行突破」/ BANG & BURN
シーズン 3, エピソード 8脱獄は失敗した―。その上、ルチェロに脱獄を企てたことがばれ、彼も連れて出るよう要求される。ウィスラーは、直接面会に来た組織の一員スーザン(グレッチェン)に、4日以内に再び脱獄をすると告げる。しかしその矢先、スーザンの元に組織のトップ"閣下"が登場。今日中に脱獄を強行するよう命じる。
第9話「籠のトリ」/ BOXED IN
シーズン 3, エピソード 9組織が強行した脱獄作戦も失敗に終わった。有名な脱獄犯マイケルが入所して以降、脱獄騒動が立て続けに発生。ＳＯＮＡを監督する指揮官は、マイケルを別の場所へ移すことに。その場所とは、ＳＯＮＡの前に置かれた懲罰箱だった。炎天下の中ビニールで囲まれた箱に放置され、マイケルは極限状態に…。
第10話「裏切り者に死を」/ DIRT NAP
シーズン 3, エピソード 10指揮官へグレッチェンの存在を話し、マイケルは懲罰箱から生還した。しかし彼が不在の間に状況が一変。ティーバッグと、ＳＯＮＡへ戻されたアレックスも計画へ加わり、ルチェロの部屋から続く地下の穴掘りを進めることに。しかしその矢先、ルチェロは手下のサミーにボスの座を奪われてしまう。
第11話「7人の夜」/ UNDER AND OUT
シーズン 3, エピソード 11べリックも加わり総勢6名が、明日の午後までに地上へと続く穴の貫通を目指す。しかしその時、突然の雨が…。雨水が染み込み、地下の穴は崩落の危機に。そこでマイケルは、急きょ皆に今夜決行すると伝える。そんな緊迫した状況の中、マクグレディが仲間に入れてほしいとマイケルの元へやって来る。
第12話「天国と地獄」/ HELL OR HIGH WATER
シーズン 3, エピソード 12遂に決行の瞬間が来た!!停電はたったの30秒間。ルチェロとティーバッグ、べリックの3人は我先に地上へ飛び出し、フェンスを目指す。
第13話「駆引きの行方」/ THE ART OF THE DEAL
シーズン 3, エピソード 13ウィスラーを連れ、ＳＯＮＡから脱出したマイケルだったが…。肝心のウィスラーが、組織の一員であると発覚！そこでマイケルは、ウィスラーを使い、組織へ強硬な手段を取ることに。
