シーズン3 あらすじ
第1話
シーズン2で登場したモン＝エルはダクサム星の王子で、初めの頃はカーラともぶつかり合っていたが、徐々に互いは惹かれあうようになる。様々な出来事を通して思いを通わせた二人だったが、モン＝エルの母が地球侵略を企んだことでモン＝エルも地球を去らざるをえなくなった。シーズン3では、モン＝エルとの別れを経て悲しみにくれるも、カーラはスーパーガールとして人々を助けることで寂しさを紛らわせようと奮闘している。
そんな中、海中に宇宙船が見つかり、中にはなんと３１世紀からやってきたモン＝エルが乗っていた。カーラは喜びにわきあがるも、船には女性の姿もあり、モン＝エルとの関係を聞かされ驚愕してしまう。
また、シーズン3では新たな敵として支配者“レイン”が登場。“レイン”はL・コープの後継者のサマンサ・“サム”・アリアスが覚醒した姿で正義を果たすために、人間の世界を焼き尽くすことを使命に無差別殺人を繰り返していた。果たしてカーラや特異生物対策局（ＤＥＯ）は“レイン”を止めることができるのか？そして元のサムを取り戻すことができるのか？